回国后，吴孟超还只是一个17岁的少年，无法远去延安从而选择了科学救国的道路。就这样，他进入了昆明的同济大学附中学习高中的课程。在这里，他也遇上了陪伴他一生的妻子，日后著名妇产科专家吴佩煜。
1943年，吴孟超考入了同济大学深造，因为妻子选择了医学。毕业后成为一名外科军医，就业于华东军区人民医 。在这里，吴孟超有幸结识了裘法祖，裘法祖是肝胆外科和器官移植外科的主要创始人和奠基人，在裘法祖老师的指导下，他不仅学习了裘氏刀法，还选择了钻研当时的医学空白领域，肝胆科。那个时候的中国不仅是肝病高发的国家，肝脏手术还是生命的禁区，因为成功率极低，一个患者被确诊肝病，几乎就等同于死亡。
此后，这个身高仅有1米62的男人，加上手术室常备的一条凳子，顶起了中国肝胆外科的一片天空。
1958年，吴孟超翻译出了中国第一本肝脏外科方面的书籍，后来，又花费一年的时间制作了108个肝脏标本，60个固定标本。而后从肝脏方面的实验转为亲自操刀肝脏科的临床手术。
【大医精诚 妙手成春】
1960年，39岁的吴孟超第一次主刀，为一名中年女子成功切除了肿瘤，打破了肝癌无法战胜的历史，也是二军医大第一附属医院肝脏手术首获成功，此后“吴氏刀法”开始在国内外医学界声名鹊起。
吴孟超还独创了“常温下间歇性肝门阻断切肝法”、发现了“正常和肝硬化肝脏手术后生化代谢规律”，突破了“中肝叶”手术的禁区。这些不仅是中国医学的一大进步，也让世界医学史迈出重要一步。
1993年5月，“东方肝胆外科医院”和“东方肝胆外科研究所”成立，他坚持把这个医院建成世界一流的肝胆外科医院，把研究所培养成世界一流的肝癌研究中心。1996年，医院建立了中德合作生物信号转导研究中心、中美合作肿瘤免疫和生物治疗中心等基础研究实验室。
2000年以来，吴孟超又带领团队建立世界上最大的肝癌样本库，肝癌介入疗法、生物治疗、免疫治疗、病毒治疗等方法也相继应用于临床。经过长期努力，使得肝脏外科手术死亡率降低为0.3%。
2004年，刚刚大学毕业的患者王甜甜发现自己腹部一天天长大，在医院检查以后发现，肝上长了一个巨大的海绵状血管瘤，位于中肝叶，严重压迫肝门，去了很多家医院都说没有办法治疗，要花费一大笔钱进行肝移植。抱着最后一线希望她跑到上海找到了吴孟超，经过多次专家会诊，最终决定将肿瘤切除。也有人劝吴老不要做这么大风险的手术，会影响自己的名声。他以我不过是吴孟超!来回应别人的劝说。
9月24日，经过十个小时的手术，已经82岁的吴孟超成功切除了足有篮球大小的肿瘤，甜甜重获新生。
2006年春天，为了集合多方力量研究和攻克肝癌，吴孟超联合其他六位院士向国务院提交了“集成式研究乙肝肝炎肝癌”的建议案，被列入国家重大科技项目专项。如今，由他主持的国家肝癌科学中心已经建立，并且成为亚洲最大的肝癌研究和防治基地。
2007年的冬天，江西一名患者找到他求治。在此之前，这位被肝癌和肝硬化折磨的患者已经遭受多家医院的拒收，吴孟超亲切地拉着他，轻声安慰还用自己的额头量体温，这也让这位患者潸然泪下。他组织了两次会诊，并且亲自主刀，经过6个小时，手术成功，患者体内的肿瘤被切除。
从医的七十多年里，他像一个超人，拯救着数万个病人们。不论病情多么复杂，他都尽自己最大的努力从死神的手里抢人。
【播桃育李 培育高徒】
吴孟超不仅在肝脏医疗科学上面潜心钻研，还一直坚持着播桃育李，为祖国的肝脏医学培养了一大批人才。
1978年，国家要求大家培养研究生，吴孟超主动向组织打报告，请求带硕士和博士，打造了我国肝脏外科专业梯队人才。因为对医术的谨慎用心，他学生中的大多数都曾被他凶过。
严以群是吴孟超带出来的博士生，一直以来，他都觉得自己的老师很严厉，动不动就会被”熊“。在担任吴孟超的协理医生时，他的某位研究生同学在医院实习，病人需要开一种药，这个同学没有处方权利，所以找到严以群帮忙。这件事情被院里知道后要在全院通报。吴孟超知道后狠狠地批评他并要求写检讨书。自己私下又在院长那里求情。等到严以群的检讨拿过来时，他让严以群自己留着，时刻提醒自己不要再犯同样的错误。
在他的教学下，肝脏外科的研究生已经培养了600多名研究生，他的团队也成了我国肝胆科研人才培育的摇篮，他培育的硕士生、博士生和博士后绝大多数已经成为我国肝脏外科团队中的中坚力量，全国将近80%的肝胆外科主要医生都出自他的门下，推动了我国肝脏外科的进步。比如他的爱徒沈峰取得了多项科研成果，在1996年被评为”科技新星“。
对学生严谨，对待自己的患者，吴孟超却一直都很和蔼。说冬天的时候，吴老总是会把自己的手搓热才给病人检查身体，做完检查以后还会帮他们把衣服拉好，还将患者的鞋子排放整齐。碰到不理解的患者时，吴老就会用笔给他们画图演示，他觉得和病人解释就相当于是“谈恋爱”，尽力为患者减轻费用负担。
他也有疲惫的时候，紧张的手术会使手术衣都湿透。手术后的吴孟超会靠在椅子上，以扶手支撑着乏力的胳膊。但是他还不忘对身边的护士说着如果有一天，他真的在手术室里倒下，记住帮他擦干净，不要让别人看见他一脸汗的样子，他极爱干净的，他说自己的手比脸还重要。
2023年1月，97岁的他光荣退休了，在他的退休仪式上他动情地说到，虽然退休了，但只要组织需要，只要病人需要，我随时可以进入战位，投入战斗！我觉得我身体还可以，所以我有信心，也有决心。所以退休后的他还是一如既往的临床进病房，阅读最新的学术资料，继续在他热爱的领域里发光发热。
从背井离乡到回到祖国，从从军到初涉医学，再到肝胆外科的半边天，他的一生既波澜起伏又细水长流，既功名显赫、“战功”累累，又始终操劳、初心不改。“中国自古以来，就有埋头苦干的人，就有拼命硬干的人，就有为民请命的人，就有舍身求法的人。他们是中国的脊梁。“吴孟超正如鲁迅笔下的中国脊梁，更以75年的时间诠释着”医者仁心“。查看
